河南科技大学物理工程学院
 首页  学院概况  机构设置  师资队伍  本科生教育  研究生教育  学生工作  科学研究  实验中心  联系我们  学科建设 
最新消息: · 物理工程学院举办篮球友谊赛         · 物理工程学院开展 “三.八”节校园赏春健身活动         · 大学物理教研室党支部集体观看记录片《重道之师—高松》         · 物理实验教学中心党支部开展“两学一做”第四专题学习         · 物理工程学院光电专业2013级学生开展LED显示屏组装、调试等毕业实习活动         · 物理工程学院成功举办2016级太极拳比赛         · 物理工程学院青协开展社会主义核心价值观主题宣传月之“撒下一点绿色,收获一片绿意”主题活动         · 物理工程学院积极开展社会主义核心价值观主题宣传月之义务浇树活动         · 物理工程学院积极参与学校“三八”国际妇女节系列活动         · 物理科学与创新协会举办如何使用proteus活动   
院内下载
· 2015--物理工程学院-学科提升任务书...
· 2015--物理工程学院学生学术讲座听...
· 2015--学生德智体综合测评实施细则 ...
· 2015--物理工程学院国家助学金评选...
· 2015--物理工程学院国家励志奖学金...
· 2015--关于《物理工程学院全勤奖发...
· 2015--物理工程学院学科建设软件费...
· 2015--关于《物理工程学院学科建设...
· 2015--物理工程学院教师(实验人员)...
· 2015--关于郭杨等同志职务任命的通...
文章内容页
当前位置: 首页>>学科建设>>研究方向>>正文

生物大分子分子动力学模拟
2017-03-19 20:51  

                     所属领域: 信息

           

           

河南科技大学物理工程学院

科技创新团队支持计划

团队名称  生物大分子分子动力学模拟    

团队带头人:        张大为              

研究方向:  极化力场在蛋白模拟中的应用

起止时间      2017.1-2020.12          

通讯地址  河南省洛阳市开元大道263号  

联系电话:     15136335216        

河南科技大学物理工程学院制

〇一四

一、填写要实事求是、内容翔实、文字精炼。本任务书将作为计划验收依据之一。

二、申报领域指学院科技创新团队申报专业技术领域

二、本任务书一式二份。学院审核签章后,学院留存一份;计划承担团队带头人)留存一份

三、“所属领域”包括:数理、化学化工、农业生物、能源、信息、资源环境、材料、先进制造及交叉与前沿学科。

每份任务书按照计划下达通知选填其中之一。请在任务书上注明所属领域的具体类别,如“所属领域:材料”。

四、计划研究时间一般为3年。

五、任务书页面用A4纸,内文用4号宋体字打印,标题用4号黑体字打印,于左侧加软封面装订成册(不要用塑料封面或塑料文件夹)。

六、填写内容较多,可附页。


一、团队基本情况

团队名称

生物大分子分子动力学模拟

所属领域

生命科学

计划编号

研究起止时间

2017.1-2020.12

研究方向

极化力场在蛋白模拟中的应用

(一)团队带头人简况

姓    名

张大为

性别

出生年月

1971.09

专业技术职务及受聘时间

特聘教授,2016.1

行政职务

最终学位

及授予学校、时间、专业

博士,美国纽约大学,2005.5,理论与计算化学

所在工作单位

(院、系、所、实验室、中心)

物理工程学院

办公电话

移动电话

15136335216

电子信箱

sunstar53@126.com

获各类人才培养计划和人才基金情况

(1) 国家自然科学基金面上项目,beta-hairpinbeta-barrel:朊病毒蛋白构象改变新机制的理论研究2017.1-2020.12

(2) 河南科技大学特聘教授启动经费,2016.1-2020.12

个人简

(包括学习、进修和科研工作情况)

张大为,男,汉族,理学博士。1993年毕业于南开大学化学系,1996年在南开大学新能源材料化学研究所获得硕士学位后留校任教。1999年赴美留学,2005年在美国纽约大学化学系获得博士学位。之后在美国纽约大学医学院从事博士后研究,20062008年在纽约大学任职助理研究员。2008年应聘到新加坡南洋理工大学任教。2016年起应聘到河南科技大学物理工程学院先后在JACS, SR, JCP, JCC, Proteins等刊物发表学术论文60余篇。对于量子分块算法以及用于分子动力学模拟的极化力场的研究有独到见解。其代表作(JCP 119, 3599,2003)单篇被引用近280次,文章总引用次近1500次,H-index21

主要学术和社会兼

International Journal of Molecular and Theoretical Physics, EC Nutrition, Journal of Chemistry and Application, HIV Advance Research and Development, Journal of HIV for Clinical and Scientific Research编辑部委员。

(二)团队人员构成

总人数

6

40周岁以上

1

40周岁以下(含)

5

专业技术职务

正高级

副高级

中级

1

1

4

学位

博士

硕士

学士

6

(三)团队成员简况

姓 名

性别

出生

年月

专业技术

职位/学位

在团队中的作用

研究骨干

刘汇慧

1979.10

副教授/博士

蛋白-配体相互作用

王会娴

1980.7

讲师/博士

蛋白折叠模拟

李海生

1981.9

讲师/博士

极化电荷模型PSBC的开发

王昶清

1980.9

讲师/博士

极化电荷模型PSBC的开发

朱卫利

1982.8

讲师/博士

蛋白-蛋白相互作用

团队成员

二、团队拟开展的主要研究内容

主要研究方向:极化力场在蛋白模拟中的应用

科学问题:为了精确描述生物大分子的静电相互作用,进而从分子动力学模拟中获取更准确的动力学信息和热力学信息,需要改进现有的分子力场,使其能够描述每个原子在模拟过程中所处的不同的静电环境。

技术问题:课题组与美国纽约大学John Zhang教授合作,陆续发展了蛋白质专属的极化电荷PPC和‘氢键专属的浮动极化电荷AHBC,并在这些工作的基础上,独立发展了模拟精准度更高的局部可调的PPC极化电荷(LPPC)以及‘蛋白质二级结构专属’的浮动极化电荷PSBC,并做了大量的基准测试来验证方法的准确性和可靠性。

应用前景:发展的极化力场可以准确描述蛋白质在凝聚态的能量和焓,很好地平衡蛋白质二级结构螺旋和b片在模拟中的稳定性,弥补现有分子力场的缺陷。

三、预期目标及提供成果形式

1、发表SCI收录论文:10-15篇,核心3-5篇。

2、申请国家级项目1项,省部级项目1-2项。

3、申请专利:1-2项。

4、四年累计校经费:150万元。

5. 评上教授职称1人,副教授职称1-2人,培养研究生1-2人。

四、尚需设备及条件

本团队建设所需条件:

硬件设施方面:

1、 工作站3

2、 128核服务器(计划采购中)

3、 其他按学院仪器库进行建设

人力资源方面:

1、 引进方向相近博士1-2

五、签署意见

团队意见:

生物大分子动力学模拟团队成员对开展生物大分子模拟所涉及的计算软件、计算方法都有充分的了解和掌握,具有较强的理论功底和数据分析能力。课题组与美国纽约大学、华东师范大学等研究小组保持着密切的联系和合作关系。这些都对我们研究工作的开展提供了支持。此外,团队预期目标明确,预期成果丰硕;具备了进行重点建设的前期基础。请学院在实验场地、人员引进、项目申报及职称评定等方面提供支持。

团队带头人签字:

年   月   日

学院意见(对团队匹配资助经费及所需人力、物力条件保障等签署具体意见):

院长签名:                (公 章)

年   月   日

关闭窗口

 

河南科技大学物理工程学院  地址:中国 洛阳 开元大道263号
邮编:471023