物理工程学院的前身是1952年成立的洛阳工学院基础课教学部。

2001年，应用物理学本科专业开始招生；同年，学校将基础部更名为数理系。

河南科技大学组建后，于2004年，数理系更名为理学院。

2005年，凝聚态物理专业硕士学位授权点申报成功，2007年开始招收硕士研究生。

2009年，学校成立物理与工程学院。

2013年，学院更名为物理工程学院。